五、分支機(jī)構(gòu)如何預(yù)繳和匯算清繳 

　　國稅發(fā)[2008]28號(hào)規(guī)定，企業(yè)應(yīng)根據(jù)當(dāng)期實(shí)際利潤額，按照本辦法規(guī)定的預(yù)繳分?jǐn)偡椒ㄓ?jì)算總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)的企業(yè)所得稅預(yù)繳額，分別由總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)在每月或季度終了后15日內(nèi)，自行向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)預(yù)繳。在規(guī)定期限內(nèi)按實(shí)際利潤額預(yù)繳有困難的，經(jīng)總機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)認(rèn)可，可以按照上一年度應(yīng)納稅所得額的1/12或1/4，由總機(jī)構(gòu)、分支機(jī)構(gòu)在每月或季度終了后15日內(nèi)，自行向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)預(yù)繳。預(yù)繳方式一經(jīng)確定，當(dāng)年度不得變更。 

　　（一）各分支機(jī)構(gòu)預(yù)繳的比例分配 

　　總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分期預(yù)繳的企業(yè)所得稅，50%在各分支機(jī)構(gòu)間分?jǐn)傤A(yù)繳。 

　　總機(jī)構(gòu)在每月或每季終了之日起十日內(nèi)，按照以前年度（1－6月份按上上年，7－12月份按上年）各省市分支機(jī)構(gòu)的經(jīng)營收入、職工工資和資產(chǎn)總額三個(gè)因素，將統(tǒng)一計(jì)算的企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納稅額的50%在各分支機(jī)構(gòu)之間進(jìn)行分?jǐn)偅倷C(jī)構(gòu)所在省市同時(shí)設(shè)有分支機(jī)構(gòu)的，同樣按三個(gè)因素分?jǐn)偅?，各分支機(jī)構(gòu)根據(jù)分?jǐn)偠惪罹偷剞k理繳庫，所繳納稅款收入由中央與分支機(jī)構(gòu)所在地按60：40分享。分?jǐn)倳r(shí)三個(gè)因素權(quán)重依次為0.35、0.35和0.3.各分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)傤A(yù)繳額按下列公式計(jì)算： 

　　各分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)傤A(yù)繳額＝所有分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分?jǐn)偟念A(yù)繳總額×該分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偙壤?nbsp;

　　其中：所有分支機(jī)構(gòu)應(yīng)分?jǐn)偟念A(yù)繳總額＝統(tǒng)一計(jì)算的企業(yè)當(dāng)期應(yīng)納稅額× 50% 

　　該分支機(jī)構(gòu)分?jǐn)偙壤剑ㄔ摲种C(jī)構(gòu)經(jīng)營收入/各分支機(jī)構(gòu)經(jīng)營收入總額）×0.35＋（該分支機(jī)構(gòu)職工工資/各分支機(jī)構(gòu)職工工資總額）×0.35＋（該分支機(jī)構(gòu)資產(chǎn)總額/各分支機(jī)構(gòu)資產(chǎn)總額之和）× 0.30 

　　以上公式中，分支機(jī)構(gòu)僅指需要參與就地預(yù)繳的分支機(jī)構(gòu)。其余50%由總機(jī)構(gòu)預(yù)繳。 

　　（二）匯算清繳 

　　總機(jī)構(gòu)在年度終了后5個(gè)月內(nèi)，應(yīng)依照法律、法規(guī)和其他有關(guān)規(guī)定進(jìn)行匯總納稅企業(yè)的所得稅年度匯算清繳。因此，各分支機(jī)構(gòu)不進(jìn)行企業(yè)所得稅匯算清繳。 

　　六、匯總納稅中分支機(jī)構(gòu)其他重要事項(xiàng) 

　　（一）分支機(jī)構(gòu)不再單獨(dú)享受稅收優(yōu)惠 

　　新法實(shí)施后，享受企業(yè)所得稅優(yōu)惠政策的主體為法人企業(yè)，不再對(duì)某一獨(dú)立核算的分支機(jī)構(gòu)單獨(dú)享受。因此新稅法實(shí)施后，匯總納稅企業(yè)與無分支機(jī)構(gòu)的企業(yè)享受享受稅收優(yōu)惠是一致的。總機(jī)構(gòu)享受的優(yōu)惠政策，也就是分支機(jī)構(gòu)可以享受的優(yōu)惠政策。 

　　由于舊稅法的企業(yè)所得稅納稅主體為獨(dú)立核算的納稅人，獨(dú)立核算的分支機(jī)構(gòu)如果符合條件按獨(dú)立納稅人享受減免稅優(yōu)惠，導(dǎo)致總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)稅率不一致。為了解決上述問題，政策規(guī)定，企業(yè)在2007年3月16日之前設(shè)立的分支機(jī)構(gòu)可以單獨(dú)享受國發(fā)企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策。但《關(guān)于跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理若干問題的通知》（國稅函[2009]221號(hào)）文件明確：“除《國務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策的通知》（國發(fā)[2007]39號(hào)）、《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于企業(yè)所得稅若干優(yōu)惠政策的通知》（財(cái)稅[2008]1號(hào)）和《財(cái)政部、國家稅務(wù)總局關(guān)于貫徹落實(shí)國務(wù)院關(guān)于實(shí)施企業(yè)所得稅過渡優(yōu)惠政策有關(guān)問題的通知》（財(cái)稅[2008]21號(hào)）有關(guān)規(guī)定外，跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)不得按照上述總分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)的計(jì)算方法計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅，應(yīng)按照企業(yè)適用統(tǒng)一的稅率計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅。” 

　　《國家稅務(wù)總局關(guān)于進(jìn)一步明確企業(yè)所得稅過渡期優(yōu)惠政策執(zhí)行口徑問題的通知》（國稅函[2010]157號(hào)）第二條規(guī)定：“關(guān)于居民企業(yè)總分機(jī)構(gòu)的過渡期稅率執(zhí)行問題：居民企業(yè)經(jīng)稅務(wù)機(jī)關(guān)核準(zhǔn)2007年度以前依照《國家稅務(wù)總局關(guān)于外商投資企業(yè)分支機(jī)構(gòu)適用所得稅稅率問題的通知》（國稅發(fā)[1997]49號(hào)）規(guī)定，其處于不同稅率地區(qū)的分支機(jī)構(gòu)可以單獨(dú)享受所得稅減低稅率優(yōu)惠的，仍可繼續(xù)單獨(dú)適用減低稅率優(yōu)惠過渡政策；優(yōu)惠過渡期結(jié)束后，統(tǒng)一依照《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法〉的通知》（國稅發(fā)[2008]28號(hào)）第十六條的規(guī)定執(zhí)行。” 

　　因此，新稅法實(shí)行法人所得稅制，除過渡期優(yōu)惠政策外，作為不具備法人資格的分支機(jī)構(gòu)，是不能單獨(dú)享受新稅法中的優(yōu)惠政策的。 

　　同時(shí)，國稅發(fā)[2008]28號(hào)和國稅函[2009]221號(hào)都對(duì)上述總分支機(jī)構(gòu)處于不同稅率地區(qū)如何計(jì)算并繳納企業(yè)所得稅作出了詳細(xì)地規(guī)定。 

　　（二）分支機(jī)構(gòu)以前年度虧損由匯總企業(yè)彌補(bǔ) 

　　國稅發(fā)[2008]28號(hào)文件規(guī)定：“總機(jī)構(gòu)和分支機(jī)構(gòu)2007年及以前年度按獨(dú)立納稅人計(jì)繳所得稅尚未彌補(bǔ)完的虧損，允許在法定剩余年限內(nèi)繼續(xù)彌補(bǔ)。”解決了原獨(dú)立核算分支機(jī)構(gòu)的以前年度虧損額在新稅法下如何處理的問題，也就是2008年1月1日后分支機(jī)構(gòu)以前年度的虧損額由法人企業(yè)一并彌補(bǔ)。 

　　《企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表》（A類）中沒有單獨(dú)體現(xiàn)彌補(bǔ)分支機(jī)構(gòu)以前年度虧損的行次，《關(guān)于做好2009年度企業(yè)所得稅匯算清繳工作的通知》（國稅函[2010]148號(hào)）對(duì)彌補(bǔ)虧損填報(bào)口徑作出規(guī)定：“根據(jù)《國家稅務(wù)總局關(guān)于印發(fā)〈跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)所得稅征收管理暫行辦法〉的通知》（國稅發(fā)[2008]28號(hào)）規(guī)定，總機(jī)構(gòu)彌補(bǔ)分支機(jī)構(gòu)2007年及以前年度尚未彌補(bǔ)完的虧損時(shí)，填報(bào)企業(yè)所得稅年度納稅申報(bào)表附表四”彌補(bǔ)虧損明細(xì)表“第三列”合并分立企業(yè)轉(zhuǎn)入可彌補(bǔ)虧損額“對(duì)應(yīng)行次。” 

　　（三）分支機(jī)構(gòu)資產(chǎn)由所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)確認(rèn) 

　　國稅發(fā)[2008]28號(hào)文規(guī)定：分支機(jī)構(gòu)的各項(xiàng)財(cái)產(chǎn)損失，應(yīng)由分支機(jī)構(gòu)所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)審核并出具證明后，再由總機(jī)構(gòu)向所在地主管稅務(wù)機(jī)關(guān)申報(bào)扣除。 

　　（四）分支機(jī)構(gòu)未按分配表預(yù)繳稅款的處理 

　　國稅函[2009]221號(hào)文明確：“對(duì)應(yīng)執(zhí)行國稅發(fā)[2008]28號(hào)文件規(guī)定而未執(zhí)行或未正確執(zhí)行上述文件規(guī)定的跨地區(qū)經(jīng)營匯總納稅企業(yè)，在預(yù)繳企業(yè)所得稅時(shí)造成總機(jī)構(gòu)與分支機(jī)構(gòu)之間同時(shí)存在一方（或幾方）多預(yù)繳另一方（或幾方）少預(yù)繳稅款的，其總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅低于按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的數(shù)額的，應(yīng)在隨后的預(yù)繳期間內(nèi)，由總機(jī)構(gòu)將按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的稅款差額分配到總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)補(bǔ)繳；其總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)就地預(yù)繳的企業(yè)所得稅高于按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的數(shù)額的，應(yīng)在隨后的預(yù)繳期間內(nèi)，由總機(jī)構(gòu)將按上述文件規(guī)定計(jì)算分配的稅款差額從總機(jī)構(gòu)或分支機(jī)構(gòu)的預(yù)繳數(shù)中扣減。” 

　　可見，符合跨地區(qū)匯總納稅政策要求的應(yīng)就地預(yù)繳稅款的分支機(jī)構(gòu)，應(yīng)按總機(jī)構(gòu)分配表預(yù)繳稅款。對(duì)不按分配表預(yù)繳稅款，導(dǎo)致在當(dāng)?shù)囟嗬U或少繳的所得稅，應(yīng)由分支機(jī)構(gòu)主管稅務(wù)機(jī)關(guān)在以后的預(yù)繳申報(bào)中解決，不能在總機(jī)構(gòu)年度納稅申報(bào)表中反映。